Reapply "remove nix_shell_legacy"

This reverts commit 1232fb5af2.

pkgs/clan-cli/clan_cli/nix/allowed-packages.json

@@ -3,12 +3,14 @@
   "avahi",
   "bash",
   "bubblewrap",
+  "disko",
   "e2fsprogs",
   "git",
   "gnupg",
   "mypy",
   "netcat",
   "nix",
+  "nixos-anywhere",
   "openssh",
   "pass",
   "qemu",
@@ -18,6 +20,8 @@
   "sshpass",
   "tor",
   "util-linux",
+  "virt-viewer",
   "virtiofsd",
+  "waypipe",
   "zbar"
 ]